Collagen as a source of bioactive peptides: a bioinformatics approach

BACKGROUND: Collagen is the most abundant protein in animals and can be obtained from residues of the food industry. Its hydrolysate has many desirable properties that make it suitable as an additive in foods and cosmetics, or as a component of scaffold materials to be used in biomedicine. RESULTS: We report here the characterization of type I collagen from five different sources, namely bovine, porcine, chicken, trout and salmon, as well as their hydrolysates by means of bioinformatics tools. As expected, the results showed that bovine and porcine collagen, as well as trout and salmon collagen, can be used interchangeably due to their high identity. This result is consistent with the evolution of proteins with highly identical sequences between related species. Also, 156 sequences were found as potential bioactive peptides, 126 from propeptide region and 30 from the central domain, according to the comparison with reported active sequences. CONCLUSIONS: Collagen analysis from a bioinformatic approach allowed us to classify collagen from 5 different animal sources, to establish its interchangeability as potential additive in diverse fields and also to determine the content of bioactive peptides from its in silico hydrolysis.

Prevalencia de infección por los virus de la hepatitis B, D y por retrovirus en la etnia Matsés (Loreto, Perú) / Prevalence of retrovirus, hepatitis B and D infection in the Matsés ethnic group in Loreto, Peru

RESUMEN Para determinar la prevalencia de infección por los virus de la hepatitis B y D (VHB y VHD, respectivamente), VIH y HTLV-1/2 en la etnia matsés, después de la inmunización contra el VHB se realizó un estudio transversal y poblacional, utilizando pruebas de ELISA y qPCR en 963 pobladores. Las prevalencias de HBsAg, anti-HBc y anti-HBs fueron 3,3%, 36,0% y 58,7%, respectivamente. En el 3,1% de la población la carga viral fue mayor a 2000 UI/mL. En menores de 10 años, la prevalencia de HBsAg y anti-HBc fue 0,0% y 2,6%, respectivamente, mientras que en el 94,4% se encontraron anticuerpos protectores. La prevalencia de infección por el VIH y el HTLV-1/2 fue 1,5% y 0,6%, respectivamente. Se concluye que existen tasas bajas de infección por el VHB y el VHD en la población infantil de la etnia matsés. Asimismo, se confirma la presencia de infección por el VIH y el HTLV-1/2.

ABSTRACT Observational, cross-sectional, populational study to determine the prevalence of infection by hepatitis B virus (HBV), hepatitis D virus (HDV), human immunodeficiency virus (HIV) and human T-lymphotropic virus type 1 and 2 (HTLV-1/2) in the Matsés ethnic group, after immunization against HBV. ELISA and qPCR tests were used in 963 residents. The prevalence of HBsAg, Anti-HBc and Anti-HBs was 3.32%, 36.03% and 58.67% respectively. In 3.1% of the population the viral load was greater than 2000 IU/mL. In children under 10 years, the prevalence of HBsAg and anti-HBc was 0.0% and 2.6%, respectively, while protective antibodies were found in 94.4%. The prevalence of HIV and HTLV-1/2 infection was 1.5% and 0.6%, respectively. It is therefore concluded that there are low rates of HBV and HDV infection in the Matsés child population. Likewise, the presence of HIV and HTLV-1/2 infection is confirmed.

Prevalencia y factores asociados con la filariosis por Mansonella ozzardi en 2 comunidades periurbanas de Iquitos, 2009 / Prevalence of filariasis by Mansonella ozzardi and associated factors among 2 suburban communities of Iquitos, 2009

Introducción: Tres casos de infección por Mansonella ozzardi (M. ozzardi) en muestras de malaria que provenían de 2 comunidades periurbanas de Iquitos (Perú) dieron la sospecha de transmisión local. El objetivo del estudio fue determinar la prevalencia y factores asociados con la filariosis por M. ozzardi en estas comunidades. Materiales y métodos: Se realizó un estudio transversal en las comunidades de Laguna Azul y La Unión en Iquitos. A todos los pobladores se les tomó una gota gruesa para la detección de M. ozzardi y se les realizó una encuesta epidemiológica. Se realizó colecta de larvas y mosquitos para identificación de potenciales vectores. Se calcularon los OR ajustados (ORa) usando regresión logística múltiple. Resultados: Se evaluaron a 433 personas; 58% fueron mujeres; la mediana de edad fue de 20 años; 58,2% fueron migrantes, 3,7% pescadores y 12,9% habían viajado por las cuencas del Alto anay. La prevalencia de M. ozzardi fue de 1,4% (6/433) y el más joven de los casos tuvo 31 años; se encontró asociación con ser pescador (ORa: 8,7; IC 95: 1,1-76,0) y con haber realizado viajes por la cuenca del Alto Nanay (ORa: 11,2; IC 95: 1,2-112,5). No se evidenció densidad significativa de vectores simúlidos o culicoides. Conclusión: Las comunidades estudiadas tuvieron una baja prevalencia de M. ozzardi y por la edad de los casos y los factores asociados encontrados se sospecha infección foránea a la zona de estudio, en especial en la cuenca del Alto Nanay.

Introduction: Three cases of M. ozzardi infection from 2 suburban communities in Iquitos, Peru, led to a suspicion of local transmission. The objective of the study was to determine the prevalence of filariasis by M. ozzardi and its associated factors among these communities. Materials and methods: A cross-sectional study was performed, as well as an epidemiological survey and a thick smear blood test. Larvae and mosquitoes were collected. The adjusted OR (aOR) using multiple logistic regression was calculated. Results: A total of 433 participants were enrolled; 58% were women. The prevalence of M. ozzardi was 1.4% and the associated factors included being a fisherman (aOR: 8.7; 95%CI: 1.1-76.0) and being on the Alto Nanay river (aOR: 11.2; 95%CI: 1.2-112.5). No significant evidence of simulidos or culicoides was found. Conclusion: The low prevalence of M. ozzardi found suggests a foreign infection, probably derived from the Alto Nanay river.

Mansonelosis por Mansonella ozzardi en voluntarios para despistaje de malaria en la Amazon¡a peruana / Mansonelosis by Mansonella ozzardi in volunteers undergoing screening for malaria in the peruvian Amazon

Objetivos. Determinar la frecuencia, manifestaciones cl¡nicas y factores asociados a la infecci¢n por Mansonella ozzardi en voluntarios de una campa¤a de despistaje de malaria en el distrito de Alto Nanay en la selva amaz¢nica del Per£. Materiales y m‚todos. Se realiz¢ un estudio descriptivo, anal¡tico y transversal. Los participantes fueron entrevistados y examinados por un m‚dico y los datos fueron registrados en una ficha cl¡nica. El diagn¢stico de infecci¢n por M. ozzardi se realiz¢ mediante la t‚cnica de gota gruesa y frotis. Resultados. La frecuencia de mansonelosis en esta poblaci¢n fue 47,8% (IC 95%: 39,1–56,6). Mediante el an lisis bivariado se encontr¢ que el reporte de disminuci¢n de la agudeza visual o visi¢n borrosa y la presencia de tumoraciones subcut neas fueron los signos y s¡ntomas estad¡sticamente asociados con la infecci¢n por microfilarias (p<0,05). La regresi¢n log¡stica encontr¢ asociaci¢n estad¡stica para la residencia en localidades del r¡o Pintuyacu o Alto Nanay, la ocupaci¢n en lugares alejados del centro poblado, la presencia de tumores subcut neos y el engrosamiento de la piel (p<0,05).Conclusiones . Existe una elevada frecuencia de mansonelosis por M. ozzardi en el distrito de Alto Nanay, la cual se encontr¢ significativamente relacionada con ocupaciones realizadas fuera del centro poblado, residencia en localidades del r¡o Pintuyacu y lesiones cut neas.

Objectives. To determine the frequency, clinical features, and factors associated with M. ozzardi infection in volunteers of a malaria screening campaign in the district of Alto Nanay in the Amazon jungle of Peru. Materials and methods. A descriptive, analytical and cross-sectional study was performed. The participants were interviewed and examined by a physician and the data were recorded in a medical record. The diagnosis of M. ozzardi infection was performed using the method of thick blood smear and film. Results.The frequency of mansonelosis in this population was 47.8% (95% CI: 39.1 to 56.6). Through bivariate analysis we found that the report of decreased visual acuity or blurred vision and presence of subcutaneous tumors were the signs and symptoms statistically associated with the infection of microfilariae (p<0.05). Logistic regression found statistical association for residency in localities of the Pintuyacu or Alto Nanay rivers, employment in places far from the town center, the presence of subcutaneous tumors and skin thickening (p<0.05). Conclusions. There was a high number of mansonelosis by M. ozzardi in the district of Alto Nanay which was significantly related to working outside the town center, residing in the area of the Pintuyacu River, and skin lesions.

Síndrome pulmonar por Hantavirus (Virus Río Mamoré) en la Amazonía Peruana / Hantavirus pulmonary syndrome (Rio Mamore Virus) in the Peruvian Amazon region

La hantavirosis es una infección viral zoonótica transmitida por roedores cuya forma clínica más letal es el síndrome pulmonar por Hantavirus (SPH). La variante río Mamoré es autóctona de Sudamérica y fue descrita en roedores sin asociarla a enfermedad en humanos. Se presenta dos casos de SPH causados por hantavirus río Mamoré en la Amazonía peruana en noviembre de 2011. En ambos casos, el diagnóstico confirmatorio fue molecular, efectuados en el Instituto Nacional de Salud de Perú. Se realizó análisis filogenético del fragmento de genoma viral y la evaluación histopatológica. Ambos pacientes evolucionaron a síndrome de distrés respiratorio del adulto y estado de choque refractario. Un paciente falleció y el otro se recuperó a los doce días.

Hantavirus infection is a viral zoonotic infection borne by rodents which most letal form clinical is the Hantavirus Pulmonary Syndrome (SPH, Spanish abbreviation). The Mamore River variant originates in South America and was found in rodents without any association to human diseases. Two cases of SPH were identified in the Peruvian Amazon region in November 2011. In both cases, a molecular diagnostic testing was conducted by the Instituto Nacional de Salud from Peru. A phylogenetic analysis of a viral genome fragment and a histopathological evaluation were conducted. Both patients developed adult respiratory distress syndrome and refractory shock. A patient died and another one recovered 12 days later.

Circulación de un linaje diferente del virus dengue 2 genotipo América / Asia en la región amazónica de Perú, 2010 / Circulation of a different lineage of dengue virus serotype 2 American / Asian genotype in the Peruvian amazon, 2010

El objetivo del estudio fue determinar el genotipo del virus dengue tipo 2 (DENV-2) que circuló en la región Amazónica de Perú entre noviembre de 2010 y enero de 2011. Se analizaron ocho muestras de pacientes captados durante la vigilancia para dengue en las ciudades de Iquitos, Yurimaguas, Trujillo, Tarapoto y Lima entre noviembre de 2010 y enero de 2011 que fueron remitidas al Instituto Nacional de Salud. Se realizó el aislamiento viral en la línea C6/36 HT y la extracción del ARN viral. Se aplicaron técnicas de biología molecular para establecer el serotipo (RT - PCR múltiple) y genotipo (RT-Nested PCR de la región E/NS1) seguidas de secuenciación y análisis filogenético. El análisis filogenético reveló la introducción de un linaje diferente que ingresó a Perú a finales del 2010. Estos aislamientos encontrados en Iquitos y otras ciudades de Perú están muy relacionados con aislamientos de DENV-2 que circularon en Brasil durante el 2007 y 2008 asociados con casos de dengue grave y muertes. En conclusión se detectó la introducción de un linaje diferente del DENV-2 genotipo América/Asia en Perú que podría estar asociado con la presencia de casos más graves de dengue.

Our objective was to determine the genotype of the dengue virus type 2 (DENV-2) that circulated in the Amazon region of Peru between November 2010 and January 2011. We analyzed eight samples collected during dengue surveillance activities in the cities of Iquitos, Yurimaguas, Trujillo, Tarapoto and Lima between November 2010 and January 2011 that were sent to Insitituto Nacional de Salud. The viruses were isolated in C6/36 HT cell line. Viral RNA was extracted and the serotype (RT - PCR multiplex) and genotype (RT-Nested PCR of the region E/NS1) were determined. Finally, the E/ NS1 amplicons were sequenced and analyzed by phylogeny. The phylogenetic analysis revealed the introduction of a different lineage which entered in Peru by the end of 2010. These isolates found in Iquitos and other cities in Peru are closely related to DENV-2 isolates that circulated in Brazil during 2007 and 2008, associated with severe dengue cases and deaths. In conclusion, we detected the introduction of a different lineage of DENV-2 America / Asia genotype in Peru that could be associated with the presence of more severe cases.

Peste neumónica primaria con transmisión intrahospitalaria en La Libertad, Perú 2010 / Primary pneumonic plague with nosocomial transmission in La libertad, Peru 2010

La peste neumónica es una forma clínica de peste, de baja frecuencia y alta letalidad, transmitida por la inhalación directa de Yersinia pestis proveniente de un animal o de persona a persona. Objetivo: Describir las características clínicas y epidemiológicas de los casos de un brote de peste neumónica primaria humana en el norte de Perú. Materiales y Métodos. Se revisaron las historias clínicas de los casos confirmados de peste neumónica primaria presentados en un brote ocurrido en la región de La Libertad, en el mes de julio de 2010, asimismo, se efectuó la búsqueda e investigación de contactos. Resultados: Se identificó el caso Índice y tres casos adicionales, de estos últimos, dos fueron infecciones intrahospitalarias relacionadas con el caso índice. La presentación clínica inicial se caracterizó por fiebre de inicio súbito, escalofríos, mialgias y dolor torácico y evolución en menos de 24 horas a hipotensión arterial y cianosis. El inicio del tratamiento específico varió de 2 a 12 días, observándose que los casos con inicio precoz de tratamiento tuvieron un mejor resultado clínico. La lealtad fue de 50 por ciento (2/4). Conclusión: Se evidenció la transmisión intrahospitalaria de peste neumónica en el Perú con manifestaciones graves y alta letalidad.

Pneumonic plague is one of the clinical forms of plague, of low frequency and high mortality, transmitted by direct inhalation of Yersinia pestis coming from an animal or from person to person. Objective. To describe the clinical and epidemiological characteristics of the cases of primary pneumonic plague in an outbreak in the north of Peru. Materials and methods. The clinical records of the confirmed cases of primary pneumonic plague presenting in an outbreak occurring in La Libertad, in July 2010, were reviewed, also the search and contact investigation was performed. Results. The index case was identified, as well as three additional cases, out of these, two were nosocomial infections related to the index case. The initial clinical presentation was characterized by sudden onset of fever, chills, myalgia and chest pain, which in less than 24 hours evolved to hypotension and cyanosis. The initiation of specific treatment varied from 2 to 12 days, and cases with prompt initiation of treatment had a better clinical outcome. The lethality was 50 percent (2/4). Conclusion. Nosocomial transmission of pneumonic plague in Peru is evidenced, with severe clinical manifestations and high lethality.

Diffusional restrictions in glyoxyl-agarose immobilized penicillin G acylase of different particle size and protein loading / Restricciones para la difusión de penicilina G acilasa inmovilizada en glicosil agarosa

Particle size and enzyme protein loading are design parameters of enzyme immobilization affecting biocatalyst performance that can be varied within broad margins. Their effect on mass transfer limitations at different bulk penicillin G concentrations has been studied with glyoxyl agarose immobilized penicillin G acylase biocatalysts of average particle size of 5·10-5m and 10·10-4m at protein loadings from 15 to 130 mg/g gel. Internal diffusional restrictions were evaluated for such biocatalysts: Thiele modulus varied from 1.17 for the small particles at the lower protein load to 5.84 for the large particles at the higher protein load. Effectiveness factors at different bulk substrate concentrations were determined for all biocatalysts, values ranging from 0.78 for small particle size at 25 mM penicillin G to 0.15 for large particle size at 2 mM penicillin G. Enzyme protein loading had a strong impact on the effectiveness factors of immobilized penicillin G acylase, being it more pronounced in the case of large particle size biocatalysts. At conditions in which 6-aminopenicillanic acid is industrially produced, all biocatalysts tested were mass-transfer limited, being this information valuable for reactor design and performance evaluation.

Resistencia in vitro del Vibrio cholerae O1 a seis antimicrobianos / In vitro resistance of Vibrio cholerae O1 to six anticrobials

Se estudio la resistencia in vitro por el método de disco-difusión a 332 cepas de V. cholerae aislados en 151 adultos del Hospital Dos de Mayo de Lima, 146 de niños y 35 adultos del Hospital Carrión del Callao. Se obtuvo una resistencia promedio total del 8.4 por ciento a la ampicilina, 5.4 por ciento a la doxiciclina, 3.3 por ciento a la tetraciclina, 3 por ciento al cotrimoxazol, 0.6 por ciento a la furazolidona y ninguna a norfloxacina. No se justifica por el momento en cambio en el tratamiento antimicrobiano del cólera, que se realiza con tetraciclina o cotrimoxazol, y se tiene como alternativa en casos particulares de resistencia a la furazolidona y la fluoquinolonas

Anormalidades anatómicas de la unión coledoco pancreatico duodenal en la atresia de las vías biliares extrahepáticas / Anatomical abnormalities of the choledocho pancreatic duodenal union in the atresia of extrahepatic biliary way

Se revisaron protocolos de autopsias y estudios anatomopatológicos post-mortem de pacientes con atresia de vías biliares extrahepáticas (AVBEH) durante los años 1980-1985, mediante un estudio retrospectivo de los diferentes cortes histopatológicos en el departamento de anatomía patológica del Hospital Infantil de México (HIM). A todos se les efectúo DERIVACION PORTOYEYUNO ANASTOMOSIS por la técnica de KASAI por AVBEH: a todos se les practicó ESTUDIO ANATOMOPATOLOGICO DE LA UNION COLEDOCO-PANCREATICO DUODENAL. El estudio realizado con patología hepato-biliar logramos encuadrar en la clasificación por diámetro interno y de desembocadura al tipo III-B, anormalidad anatómica de la unión coledoco-pancreático duodenal que permite el reflujo del jugo pancreático lo que puede influir en la génesis de la AVBEH sostenido por Miyano y Cols. Sin embargo, al encontrar tipo III-B de desembocadura en el grupo control (sin patología hepato-biliar) plantea la duda sobre, si se trata de una variante normal o la verdadera causa del problema. Es importante precisar que hasta donde nosotros sabemos e investigamos no hay reporte, en la literatura mundial que considere esta duda

Síndrome de Fanconi-Bickel / Fanconi-Bickel syndrome

Se presenta el caso de un niño de un año tres meses de edad con síndrome de Fanconi-Bickel, caracterizado por las manifestaciones del síndrome de Fanconi (glucosuria, aminoaciduria y fosfaturia) y acúmulo de glucógeno en el hígado semejante a lo que se observa en la glucogenosis tipo Ia. Debido a la presencia de glucogenosis hepática el paciente también presentó hipoglucemia, cetonuria, hipercolesterolemia e hipertrigliceridemia. La glucogenosis observada en los pacientes con síndrome de Fanconi-Bickel, no depende de defecto de la actividad de la glucosa-6-fosfatasa, sino al parecer, de un defecto del transportador que moviliza la glucosa y la galactosa en el hígado y en la membrana basolateral del túbulo proximal del nefrón

Estimación del grado de actividad de los escolares según los padres y maestras, y su relación con la impulsividad cognoscitiva / Evaluation of the activity degree and its relation with cognoscitive impolsity of schoola children accodring to theis teachers and parents

El trastorno de deficiencia de la atención, o síndrome hiperquinético (SHQ), se caracteriza por hiperactividad, deterioro de la atención, deficiencia emocional e impulsividad, además de otros síntomas secundarios, como la conducta antisocial y los trastornos del aprendizaje, cuya frecuencia varía de acuerdo con la etiología del síndrome. De estos síntomas característicos del SHQ, la hiperactividad y la impulsividad han recibido bastante atención de los investigadores y del público en general. Hay pocos instrumentos con valor diagnóstico para medir la hiperactividad; entre los más confiables se encuentran la escala de actividad de Conners y la de Werry-Weiss-Peters. La terea de igualar figuras familiares (MFF) para medir la impulsividad, con base en el contructo de refleción-impulsividad, también se usa mucho para diagnosticar el síndrome hiperquinético. En nuestro medio, los padres de familia y los maestros de educación primaria son los primeros en etiquetar indiscriminadamente a los niños como hiperactivos, basándose en criterios subjetivos, y no en escalas, lo cual puede tener consecuencias adversas para su desarrollo biopsicosocial. A pesar de que cada vez se usa más el SHQ, se cuenta con poca información acerca de la hiperactividad de los escolares mexicanos, de la concordancia o discrepancia entre los criterios de los maestros y de los padres para calificar a los niños como hiperactivos, y de las características sobresalientes de su comportamiento. Por otra parte, la prueba MFF está contaminada por factores perceptomotrices que no pretende medir, por lo que puede ser totalmente inadecuada para diagnosticar el SHQ. Es por ello que creemos que sería útil aportar datos para aclarar este punto y evitar que se use indiscriminadamente en México...

Algunas evidencias acerca de la contaminación motriz del tiempo conceptual / Some evidences of the motor contamination of the conceptual time

Este estudio fue diseñado para corroborar si el constructo del tiempo conceptual está contaminado por los tiempos motrices. Kagan desarrolló en un principio la tarea MFF basándose en la hipótesis de que tiempos largos de decisión en situaciones de alta inceridumbre%incertidumbre eran representativos de una disposición llamada "reflexión" y tiempos más breves eran representativos de una disposición llamada "impulsicidad". Posteriormente, Kagan y sus colaboradores usaron un índice dual que consistía en las latencias de la respuesta y el total de errores en la tera MFF y enunciaron varios criterios acerca del uso e interpretación de la tarea MFF (Kagan & Messer, 1975). Sin embargo, en la investigación posterior, la generalización de la dimensión de R-I a conductas cotidianas ha sido aceptada, y los fundamentos psicométricos han sido de mayor interés para los investigadores. Diseñamos este estudio basándonos en nuestras investigaciones anteriores, según las cuales, la generalización de la dimensión de R-I ocurre bajo condiciones que, de acuerdo a los postulados de Kagan, no deberían ocurrir. Con el propósito de corroborar nuestro hallazgo, escogimos el método multirasgomultimétodo (MR-MM; Campbell & Fiske, 1959) y enunciamos varias hipótesis en términos de validez convergente y discriminante. Esperábamos encontrar una validez convergentes entre la MFF y la prueba Raven de Matrices Progresivas, y una validez discriminante entre estas tareas y algunos reactivos de la prueba de Frostig (DLR) y de una tarea visomotriz diseñada por nosotros (TN: Solís-Cámara, Alatorre & Solís-Cámara, 1981). Los resultados fueron semejantes a los encontrados por Hall y Russel (1974) en cuanto a la validez convergente de las latencias entre las tareas MFF y Raven. En cuanto a los errores entre estas tareas, éstos no se relacionaron como ocurrió en el estudio de Hall y Russel...

Enfermedad de Tangier: presentación de un caso / Tangier's disease: report of a case

Se discuten los hallazgos histopatológicos de una niña de 6 años de edad, que presentó amígdalas hipertróficas y amarillas, así como infiltración por macrófagos en múltiples órganos. Se discuten también los cambios ultraestructurales del hígado. Los niveles plasmáticos de colesterol fueron de 55.1 mg/dl (1.25 mmol/l), los triglicéridos de 337.2 mg/dl (2.8 mmol/l), lipoproteínas de alta densidad (alfalipoproteínas) 5.95 mg/dl. Todos estos datos permitieron integrar el diagnóstico de enfermedad de Tangier. Este es el primer caso que se ha observado en el Hospital Infantil de México Federico Gómez y, hasta donde conocemos, el único en México. En la literatura médica únicamente encontramos un caso más de enfermedad de Tangier con estudio postmortem

El desarrollo de la eficiencia de escolares de dos niveles socioeconómicos en una tarea de estilos / Efficiency development of school children of 2 socioeconomic levels in a work of styles

Los resultados del presente trabajo demuestran que el desempeño de los niños mexicanos de nivel socioecónomico bajo (NSB), comparado con el de los de nivel socioecónomico alto (NSA), es semejante al encontrado entre niños de otras nacionalidades con distintos NSE. Muestran, igual que los niños mexicanos de ambos tipos de NSE que tienen un desempeño más eficiente cuando son de una edad proporcionalmente semejante, tanto entre sí, como en comparación con los niños anglosajones, israelitas y japoneses, que cuando se compara a los niños mexicanos de NSE alto con los de estas otras nacionalidades, su desempeño ya no puede considerarse "impulsivo", como es el caso de aquéllos de NSE bajo